Ninja Saga on yhden pelaajan tasohyppelypeli, joka muistuttaa vanhoja kunnon kolikkopelejä. Pelin sivusuunnassa vierivät kentät on tehty klassisten tasohyppelyiden tyyliin. Matkalta löytyy kaikenmoista estettä, joista kuitenkin selviää sen suuremmitta mietteittä. Tietysti ninjalla on myös vihollisia, joista pääsee eroon sopivilla ninjatempuilla ja kentiltä kerättävillä pommeilla.